operationaltemplate.SmICS-Befund.opt Maven / Gradle / Ivy
The newest version!
ISO_639-1
de
Sarah Ballout
[email protected]
Peter L. Reichertz Institut für Medizinische Informatik
Antje Wulff
Initial
Template metadata sample set
ISO_639-1
de
Template dient dazu einen SmICS-Befund strukturiert wiederzugeben. Wichtige Informationen über die Anzahl der Erreger werden mit erfasst.
SmICS
Erreger
Infektionsweg
Übertragung
Keime
Molekulare Typisierung
Nicht zur Repräsentation von Laborbefunden anderer Bereiche wie der klinischen Chemie.
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SmICS-Befund
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Zur Erfassung von Details zur Identifikation eines Events im Gesundheitswesen.
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Eingruppierung des Kontaktes in Kategorien.
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Zusätzliche Beschreibung der Aktivität, die in anderen Bereichen nicht erfasst wurden.
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Standort umfasst sowohl beiläufige Orte (ein Ort, der für die medizinische Versorgung ohne vorherige Benennung oder Genehmigung genutzt wird) als auch spezielle, offiziell benannte Orte. Die Standorte können privat, öffentlich, mobil oder stationär sein.
Standort
Eine Gruppe von Gebäuden an anderen Orten, wie ein örtlich entfernter Campus, der außerhalb der Einrichtung liegt, aber zur Institution gehört.
Campus
Ein Gebäude oder Bauwerk. Dazu können Räume, Flure, Flügel, etc. gehören. Es hat möglicherweise keine Wände oder ein Dach, wird aber dennoch als definierter/zugeordneter Raum angesehen.
Gebäudegruppe
Eine Station ist Teil einer medizinischen Einrichtung, die Räume und andere Arten von Orten enthalten kann.
Station
Die Ebene in einem mehrstöckigen Gebäude/Bauwerk.
Ebene
Ein Ort, der als Zimmer deklariert wurde. Bei einigen Standorten kann das Zimmer im Flur liegen zB: Station XYZ Flur 2. Hierbei liegt der Bettstellplatz 2 auf dem Flur der jeweiligen Station.
Zimmer
Beschreibung des Bettstellplatzes z.B. Bett stand neben dem Fenster oder neben der Tür.
Bettstellplatz
Kategorisierung des Standorttyps, z.B. Klinik, zu Hause.
Standorttyp
Das Feld enthält die Freitextbeschreibung des Standorts, z.B. Throax-, Herz- und Gefäßchirurgie.
Standortbeschreibung
Für die Erfassung weiterer Angaben über das Bett oder der Adresse. Verwenden Sie dazu den Archetyp CLUSTER.device oder CLUSTER.address.
Details
Kodierung des Standortes, z.B. der Fachabteilungsschlüssel (z. B. 2000 Thoraxchirurgie).
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Beispiele: 'Natrium', 'Leukozytenzahl', 'T3'. Üblicherweise über eine externe Terminologie codiert.
Ergebnis eines Labortests für einen bestimmten Analytwert.
Laboranalyt-Resultat
z.B. '7.3 mmol/l', 'Erhöht'. Der 'Any'-Datentyp wird dann
durch eine Spezialisierung, eine Vorlage oder zur Laufzeit
auf einen passenden Datentypen eingeschränkt werden müssen, um das aktuelle Analyt-Ergebnis wiederzugeben. Der 'Quantity'-Datentyp hat Referenzmodell-Attribute, wie Kennungen für normal/abnormal, Referenzbereiche und Näherungen - für weitere Details s. https://specifications.openehr.org/releases/RM/latest/data_types.html#_dv_quantity_class .
(Mess-)Wert des Analyt-Resultats.
Observation.value[x]
OBX.2, OBX.5, OBX.6, OBX.7, OBX.8
Analyt-Resultat
Kommentar zum Analyt-Resultat, soweit noch nicht in anderen Feldern erfasst.
Observation.note
NTE.3
Kommentar
z.B.: 'im Referenzbereich, bezogen auf Alter und Geschlecht'.
Zusätzliche Hinweise zur Anwendbarkeit des Referenzbereichs für dieses Resultat oder (codierter) Text, ob das Resultat im Referenzbereich ist oder nicht.
Referenzbereichs-Hinweise
Die Werte wurden analog zum HL7 FHIR Diagnostic Report gewählt, die wiederum aus der HL7-Praxis stammen. Andere Codes/Ausdrücke können über den Text 'choice' verwendet werden.
Status des Analyseergebnisses.
Observation.status
OBX.11
Ergebnis-Status
Datum und/oder Zeitpunkt an dem der Status für das Analyseergebnis gesetzt wurde.
Observation.issued
OBX.19
Zeitpunkt Ergebnis-Status
Weitere Details zu einem einzelnen Ergebnis.
Analyseergebnis-Details
Der Test ist im Laborinformationssystem erfasst, aber noch kein Resultat verfügbar.
Erfasst
Das Testresultat ist ein Anfangs- oder Interimswert, vorläufig oder nicht verifiziert/validiert.
Unvollständig
Erste, verifizierte Resultate sind vorhanden, der Test ist aber noch nicht abgeschlossen (Sub-Kategorie von 'Unvollständig').
Vorläufig
Das Testresultat ist vollständig und durch eine autorisierte Person verifiziert.
Endbefund
Der Endbefund wurde erneut modifiziert, ist vollständig und wurde durch den verantwortlichen Pathologen verifiziert. Dies ist eine Unterkategorie von "Endbefund, geändert".
Endbefund, korrigiert
Der Endbefund wurde erneut modifiziert, ist vollständig und wurde durch den verantwortlichen Pathologen verifiziert. Des Weiteren haben sich die Ergebnisdaten hierdurch verändert.
Endbefund, geändert
Nach Abschluss wurde der Bericht durch Hinzufügen neuer Inhalte abgeändert. Der vorhandenen Inhalte sind unverändert. Dies ist eine Unterkategorie von "Endbefund, geändert".
Endbefund, ergänzt
Das Testresultat wurde nach Endbefundung zurückgezogen.
Endbefund, widerrufen
Das Testresultat ist nicht verfügbar, weil der Test nicht (vollständig) durchgeführt oder abgebrochen wurde.
Storniert
Der Wert dieses Elements wird normalerweise meist durch eine Spezialisierung, durch einer Vorlage oder zur Laufzeit geliefert, um den aktuellen Analyt wiederzugeben. Zum Beispiel: 'Natrium im Serum','Hämoglobin'.
Die Codierung mit einer externen Terminologie, wie LOINC, NPU, SNOMED-CT oder lokalen Labor-Terminologien wird dringend empfohlen.
Die Bezeichnung des Analyt-Resultats
Observation.code
OBX.3
untersuchter Analyt
In vielen Gerichtsbarkeiten wird angenommen, dass der 'Ergebnisstatus' die medizinische Validation einschliesst, in anderen wird diese anhand dieses Datenelements separat erfasst und befundet
Datum und Zeit, an dem das Analyseergebnis im Labor medizinisch validiert wurde.
Zeitpunkt Validation
In manchen Situationen wird ein einzelner Laborergebnis-Archetyp mehrere Probe- und Laboranalyt-Resultat-Archetypen enthalten. In diesen Fällen wird dieses 'Probe'-Datenelement benötigt, um die Resultate mit den richtigen Proben zu verknüpfen.
Kennung der Probe, die für das Analyseergebnis verwendet wurde.
Probe
z.B. '1', '2', '3'. Werden mehrere Analysenergebnisse berichtet, gibt die Analyseergebnis-Reihenfolge explizit die Reihenfolge der Analyseergebnisse an.
Die beabsichtigte Position dieses Analyseergebnisses in der Reihenfolge aller Analyseergebnisse
Analyseergebnis-Reihenfolge
Amoxycillin/Clavulansäure
Amikacin
Ampicillin
Amoxicillin
Anidulafungin
Aztreonam
Azlocillin
Azithromycin
Besifloxacin
Ceftobiprol
Cefetamet
Ceftazidim
Ceftazidim/Clavulansäure
Cefdinir
Cefaclor
Cephalothin
Cefixim
Cefoperazon
Cefadroxil
Chloramphenicol
Cefonicid
Cinoxacin
Ciprofloxacin
Clindamycin
Clarithromycin
Clinafloxacin
Cefmetazol
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Ceftarolin/Avibactam
Cefpodoxim
Cefprozil
Ceftarolin
Carbenicillin
Ceftriaxon
Ceftibuten
Cefotaxim/Clavulansäure
Cefotetan
Cefotaxim
Cefuroxim
Ceftazidim/Avibactam
Cefazolin
Ceftolozan/Tazobactam
Ceftizoxim
Dalbavancin
Danofloxacin
Daptomycin
Difloxacin
Dirithromycin
Cefditoren
Doripenem
Doxycyclin
Enoxacin
Erythromycin
Ertapenem
Faropenem
5-Fluorocytosin
Fidaxomicin
Cefepim
Finafloxacin
Fleroxacin
Florfenicol
Fluconazol
Fosfomycin
Cefoxitin
Fusidinsäure
Amphotericin B
Bacitracin
ESBL - Testung
Lincomycin
Nitrocephin
Nystatin
Roxithromycin
Gatifloxacin
Gentamicin High-Level
Gemifloxacin
Gentamicin
Garenoxacin
Grepafloxacin
Bedaquiline
Cefsulodin
Clofazimin
Cycloserin
Josamycin
Sulbactam
Capreomycin
Cefcapen
Cefpirom
Cefteram
Cefotiam
Caspofungin (E-Test)
Micafungin (E-Test)
Posaconazol (E-Test)
Flucloxacillin
para-Amino-Salicylsäure
Pristinamycin
Rifabutin
Cefoperazon/Sulbactam
Temocillin
Tosufloxacin
Zidovudin
Stavudin
Zalcitabin
Didanosin
Lamivudin
Ethambutol
Isoniazid
Foscarnet
Piperacillin/Sulbactam
Protionamid
Pyrazinamid
Iclaprim
Imipenem
Isavuconazol
Itraconazol
Kanamycin-High
Kanamycin
Cephalexin
Linezolid
Lomefloxacin
Loracarbef
Levofloxacin
Cefamandol
Mecillinam (Amdinocillin)
Meropenem
Methicillin
Meropenem/Vaborbactam
Mezlocillin
Moxifloxacin
Minocyclin
Moxalactam (Latamoxef)
Metronidazol
Mupirocin
Nafcillin
Nalidixinsäure
Neomycin
Netilmicin
Nitrofurantoin
Norfloxacin
Novobiocin
Ofloxacin
Omadacyclin
Oritavancin
Oxacillin
Penicillin G
Piperacillin
Plazomicin
Penicillin
Penicillin V
Polymyxin B
Premafloxacin
Quinupristin/Dalfopristin
Ramoplanin
Rifampin
Razupenem
Ampicillin/Sulbactam
Sarafloxacin
Sulopenem
Sulfamethoxazol
Solithromycin
Sulfisoxazol
Spectinomycin
Sparfloxacin
Sulfonamid
Streptomycin-High
Streptomycin
Sulfamethoxazol/Trimethoprim (Cotrimoxazol)
Ticarcillin/Clavulansäure
Tetracyclin
Teicoplanin
Tigecyclin
Ticarcillin
Telithromycin
Telavancin
Trimethoprim
Temafloxacin
Tobramycin
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Piperacillin/Tazobactam
Vancomycin
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Laborergebnis als Panel/Profil von Einzelresultaten. Verbreitet im medizinischen Labor.
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Weitere Details zum Panel, einschließlich der einzelnen Analyte, Proben für das Panel oder weitere, verschachtelte Panels.
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Detaillierte Angaben zum nachgewiesenen Erreger.
Erregerdetails
Semiquantitative Angabe zur Keimzahl.
Häufigkeit
Angabe zu untersuchten
Virulenzeigenschaften oder -genen, z.B. PVL bei S. aureus oder EHEC bei E. coli.
Virulenzfaktor
Ein bestes Beispiel wäre, die Untersuchung eines „Staphylococcus aureus“ der hier die Bezeichnung des Keims ist.
Bezeichnung des Resistenzmechanismus.
Resistenzmechanismus Bezeichnung
Angabe zur MRE-Klassifikation des
Erregers, z.B. 3MRGN oder 4MRGN. Bei VRE und MRSA kann es zu einer Redundanz zum Resistenzmechanismus "Methicillin-resistenz" kommen, dies ist aber problemlos.
MRE Klasse
Methicillin-resistenter Staphylococcus aureus (und CA- community-acquired, LA – lifestock acquired, HA – hospital acquired)
MRSA
Quantitative Angabe zur Keimzahl, z.B. bei Urinen
Keimzahl
Bestimmte Keimsubtypen beeinflussen die Wirtsreaktion bzw. Immunantwort.
Beispielsweise ein Resultat einer spa-Typsierung bei einem S. aureus oder anderen Typsierungen wie MLST.
Subtyp, welcher zusätzlich zur Speziesidentifizierung zur weiteren Kennzeichnung des Erregers genutzt werden kann, z.B. spa-Typ im Falle von S. aureus oder MLST-Typ.
Keim Subtyp
Multiresistente Gramnegative Bakterien (Resistenz gegen 2 der 4 Antibiotikagruppen)
2MRGN
Vancomycin-resistente Enterokokken
VRE
Linezolid-Vancomycin-resistenter Enterokokken
LVRE
Angabe der bei dem Erreger vorliegenden Resistenzmechanismen, z.B. ESBL oder Carbapenemase.
Resistenzmechanismus
Der Cluster dient dazu, weitere Ergänzungen zum Archetyp Erregerdetails aufzunehmen.
Weitere Ergänzungen
Zusätzliche Infomationen zum Erreger.
Kommentar
Ein bestes Beispiel wäre, die Untersuchung eines „Staphylococcus aureus“ der hier die Bezeichnung des Keims ist. Jedoch möchte man später nochmal die „Toxine“ des „Staphylococcus aureus“ untersuchen. Hier wären die „Toxine“ die Spezialisierung des untersuchten Keims.
Weitere Angaben zum Resistenzmechanismus.
Resistenzmechanismus Spezialisierung
Weitere Informationen werden in den Archetypen "Laboranalyt-Panel" und "Labortest-Panel" erfasst.
Benennung des Antibiogramms, zur Bestimmung der Empfindlichkeit bzw. Resistenz von mikrobiellen Krankheitserregern gegenüber Antibiotika verwendet wurde.
Antibiogramm
Multiresistente Gramnegative Bakterien (Resistenz gegen 3 der 4 Antibiotikagruppen)
3MRGN
Multiresistente Gramnegative Bakterien (Resistenz gegen 4 der 4 Antibiotikagruppen)
4MRGN
Linezolid-resistente Enterokokken
LRE
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(+)
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+
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++
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++++
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Erregertypisierung
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Zur Erfassung von Details zur Molekularen Typisierung, welches eine Differenzierung zwischen gleichen und unterschiedlichen Erregern darstellt.
Molekulare Typisierung
Angaben zu den durchgeführten Typisierungsverfahren in der Infektionskontrolle.
Art der Typisierung
Zusätzliche Angaben zu der Molekularen Typisierung.
Kommentar
*
Pulsfeldgelelektrophorese (PFGE)
*
Multilocus Sequence Typing (MLST)
*
core genom Multilocus Sequence Typing (cgMLST)
*
spa-Typisierung (Staphylococcus aureus)
*
Andere
Ergebnisse der Bilddateien der Molekularen Typisierung.
Ergebnis
Das Ergebnis bzw. die Bewertung der Molekularen Typisierung.
Bewertung
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Zur Repräsentation von Krankheiten und Erregern, welche sich durch die hohe Mobilität der Menschen über große Entfernungen und ein größeres Risikopotential für die schnelle Ausbreitung von Infektionskrankheiten und Erregern kennzeichnet.
SmICS-Ergebnis
@ internal @
Event Series
*
Jedes Ereignis
@ internal @
Baum
Dokumentation über die Angabe ob es eine Häufung oder einen Ausbruch gab.
SmICS Ergebniskategorie
Multispezies Ausbrüche sind gekennzeichnet durch die Übertragung von bestimmten mobilen genetischen Resistenz Elementen. Angaben von Ausbruch und Häufungen von mehreren Erregern.
Multispezies
Zeitpunkt an dem der Ausbruchsbeginn stattfand.
Beginn
Zeitpunkt an dem die Ausbruchsuntersuchung begann.
Beginn der Untersuchung
Zeitpunkt an dem der Ausbruch beendet wurde.
Ende
Die Gesamtdauer des Ausbruches.
Dauer
Strukturierte Angaben über den Standort eines Trägers.
Lokalisation/ Ort
Zusätzliche Infomationen zum Ausbruch bzw. zu der Häufung.
Kommentar
Der Übertragungsweg des Ausbruchs eines Erregers.
Art der Übertragung
Der Transmissionsweg des Erregers. Die direkte Infektions/ Erregerübertragung mittels verschiedener Vehikel zb. Kontaktübetragung, Aerogene Übertragung o. Tröpfchenübertragung usw ohne Zwischenschritte.
Transmissionsweg
Angaben zur Expositionsmethode. Die indirekte Infektions/ Erregerübertragung zb. Patient zu Patient, Personal auf Patient o. Punktquelle der Umwelt usw.
Übertragungsweg
Eine Erregerhäufung bzw. Ausbruch von mehrern involvierten Spezies.
Eigenschaften des beteiligten Erregers
Eine Erregerhäufung bzw. Ausbruch von mehrern involvierten Spezies.
Erregername
*
Erregerdetails
*
weitere Ergänzung
Zeitpunkt an dem der letzte Erregernachweis festgestellt wurde.
Zeitpunkt des letzten Erregernachweises
Zeitpunkt an dem der erste Erregernachweis festgestellt wurde.
Zeitpunkt des ersten Erregernachweises
*
Häufung
*
Ausbruch
*
Andere
Die Anzahl der nachgewiesenen Erreger.
Anzahl der Erregernachweise
Angaben über weitere zusätzliche Übertragungswege.
Kommentar
Abiotrophia defectiva (organism)
Achromobacter denitrificans (organism)
Achromobacter insolitus (organism)
Achromobacter piechaudii (organism)
Achromobacter ruhlandii (organism)
Genus Achromobacter (organism)
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Achromobacter xylosoxidans (organism)
Achromobacter xylosoxidans xylosoxidans (organism)
Acinetobacter baumannii (organism)
Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex (organism)
Acinetobacter baylyi (organism)
Acinetobacter bereziniae (organism)
Acinetobacter bouvetii (organism)
Acinetobacter calcoaceticus (organism)
Acinetobacter dijkshoorniae (organism)
Acinetobacter genospecies (organism)
Acinetobacter genospecies 11 (organism)
Acinetobacter genospecies 3 (organism)
Acinetobacter nosocomialis (organism)
Acinetobacter gerneri (organism)
Acinetobacter guillouiae (organism)
Acinetobacter haemolyticus (organism)
Acinetobacter johnsonii (organism)
Acinetobacter junii (organism)
Acinetobacter lwoffi (organism)
Acinetobacter pittii (organism)
Acinetobacter radioresistens (organism)
Acinetobacter schindleri (organism)
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Acinetobacter tjernbergiae (organism)
Acinetobacter towneri (organism)
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Actinomyces neuii (organism)
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Brevundimonas diminuta (organism)
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Genus Candida (organism)
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Clostridioides difficile (organism)
Clostridium innocuum (organism)
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Corynebacterium accolens (organism)
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Corynebacterium aurimucosum (organism)
Corynebacterium diphtheriae (organism)
Corynebacterium glucuronolyticum (organism)
Corynebacterium jeikeium (organism)
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Corynebacterium pseudodiphtheriticum (organism)
Genus Corynebacterium (organism)
Corynebacterium striatum (organism)
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Cronobacter dublinensis subspecies lausannensis
Cronobacter universalis (organism)
Cronobacter malonaticus
Cronobacter muytjensii
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Cronobacter turicensis
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Cryptococcus (organism)
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Delftia acidovorans (organism)
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Fusobacterium nucleatum (organism)
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Haemophilus parainfluenzae (organism)
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Inquilinus limosus (organism)
Interferon gamma assay positive (finding)
Klebsiella oxytoca (organism)
Klebsiella pneumoniae ss. ozaenae (organism)
Klebsiella pneumoniae (organism)
Klebsiella pneumoniae ss. pneumoniae (organism)
Klebsiella pneumoniae ss. rhinoscleromatis (organism)
Genus Klebsiella (organism)
Raoultella terrigena (organism)
Klebsiella variicola (organism)
Staphylococcus, coagulase negative (organism)
Kocuria kristinae (organism)
Kytococcus schroeteri (organism)
Lactobacillus casei (organism)
Lactobacillus crispatus (organism)
Lactobacillus fermentum (organism)
Lactobacillus gasseri (organism)
Lactobacillus jensenii (organism)
Lactobacillus paracasei (organism)
Lactobacillus rhamnosus (organism)
Genus Lactobacillus (organism)
Lactococcus lactis subspecies lactis (organism)
Leclercia adecarboxylata (organism)
Legionella anisa (organism)
Legionella beliardensis (organism)
Legionella birminghamensis (organism)
Legionella bozemanae (organism)
Legionella brunensis (organism)
Legionella cherrii (organism)
Legionella cincinnatiensis (organism)
Legionella dumoffii (organism)
Legionella erythra (organism)
Legionella feeleii (organism)
Legionella gormanii (organism)
Legionella hackeliae (organism)
Legionella impletisoli (organism)
Legionella israelensis (organism)
Legionella jamestowniensis (organism)
Legionella jordanis (organism)
Legionella lansingensis (organism)
Legionella longbeachae (organism)
Legionella micdadei (organism)
Legionella moravica (organism)
Legionella oakridgensis (organism)
Legionella parisiensis (organism)
Legionella pneumophila (organism)
Legionella pneumophila serogroup 1 (organism)
Legionella pneumophilia serogroup 10 (organism)
Legionella pneumophilia serogroup 11 (organism)
Legionella pneumophilia serogroup 12 (organism)
Legionella pneumophilia serogroup 13 (organism)
Legionella pneumophilia serogroup 14 (organism)
Legionella pneumophila serogroup 2 (organism)
Legionella pneumophila serogroup 3 (organism)
Legionella pneumophila serogroup 4 (organism)
Legionella pneumophila serogroup 5 (organism)
Legionella pneumophila serogroup 6 (organism)
Legionella pneumophila serogroup 7 (organism)
Legionella pneumophila serogroup 8 (organism)
Legionella pneumophila serogroup 9 (organism)
Legionella rubrilucens (organism)
Legionella sainthelens (organism)
Legionella santicrucis (organism)
Genus Legionella (organism)
Legionella tucsonensis (organism)
Legionella wadsworthii (organism)
Legionella yabuuchiae (organism)
Leuconostoc lactis (organism)
Listeria monocytogenes (organism)
Staphylococcus aureus (organism)
Microbacterium flavescens (organism)
Micrococcus luteus (organism)
Moraxella catarrhalis (organism)
Subgenus Moraxella (organism)
Moraxella lacunata (organism)
Moraxella nonliquefaciens (organism)
Moraxella osloensis (organism)
Morganella morganii (organism)
Morganella morganii subsp morganii (organism)
Morganella morganii subsp sibonii (organism)
Mycobacterium abscessus (organism)
Mycobacterium africanum (organism)
Mycobacterium avium (organism)
Mycobacterium bovis (organism)
Mycobacterium bovis subspecies bovis (organism)
Mycobacterium caprae (organism)
Mycobacterium chelonae (organism)
Mycobacterium tuberculosis complex (organism)
Mycobacterium gordonae (organism)
Mycobacterium intracellulare (organism)
Mycobacterium kansasii (organism)
Mycobacterium microti (organism)
Genus Mycobacterium (organism)
Mycobacterium tuberculosis (organism)
Genus Mycoplasma (organism)
Genus Myroides (organism)
Neisseria gonorrhoeae (organism)
Neisseria meningitidis (organism)
Genus Neisseria (organism)
Neisseria subflava (organism)
Gamma-hemolytic streptococcus (organism)
Genus Nocardia (organism)
Ochrobactrum anthropi (organism)
Pantoea agglomerans (organism)
Pantoea ananatis (organism)
Mixta calida (organism)
Pantoea dispersa (organism)
Pantoea septica (organism)
Genus Pantoea (organism)
Pantoea stewartii (organism)
Tatumella terrea (organism)
Parabacteroides distasonis (organism)
Parvimonas micra (organism)
Pasteurella aerogenes (organism)
Pasteurella bettyae (organism)
Pasteurella canis (organism)
Pasteurella dagmatis (organism)
Mannheimia haemolytica (organism)
Pasteurella mairii (organism)
Pasteurella multocida (organism)
Pasteurella pneumotropica (organism)
Genus Pasteurella (organism)
Pasteurella stomatis (organism)
Pediococcus acidilactici (organism)
Pediococcus pentosaceus (organism)
Penicillium (organism)
Peptoniphilus asaccharolyticus (organism)
Peptoniphilus harei (organism)
Genus Peptoniphilus (organism)
Peptostreptococcus anaerobius (organism)
Genus Pichia (organism)
Pneumocystis jirovecii (organism)
Prevotella bergensis (organism)
Prevotella bivia (organism)
Prevotella buccae (organism)
Prevotella denticola (organism)
Prevotella disiens (organism)
Prevotella intermedia (organism)
Prevotella melaninogenica (organism)
Prevotella nanceiensis (organism)
Prevotella oris (organism)
Genus Prevotella (organism)
Cutibacterium acnes (organism)
Genus Propionibacterium (organism)
Proteus hauseri (organism)
Proteus mirabilis (organism)
Proteus myxofaciens (organism)
Proteus penneri (organism)
Genus Proteus (organism)
Proteus vulgaris (organism)
Providencia alcalifaciens (organism)
Providencia heimbachae (organism)
Providencia rettgeri (organism)
Providencia rustigianii (organism)
Genus Providencia (organism)
Providencia stuartii (organism)
Providencia vermicola (organism)
Flavimonas oryzihabitans (organism)
Pseudomonas aeruginosa (organism)
Mucoid Pseudomonas aeruginosa (organism)
Pseudomonas citronellolis (organism)
Pseudomonas fluorescens (organism)
Pseudomonas fluorescens group (organism)
Pseudomonas koreensis (organism)
Chryseomonas luteola (organism)
Pseudomonas mendocina (organism)
Pseudomonas putida (organism)
Genus Pseudomonas (organism)
Pseudomonas species not aeruginosa (organism)
Pseudomonas stutzeri (organism)
Raoultella ornithinolytica (organism)
Raoultella planticola (organism)
Genus Raoultella (organism)
Rhizobium radiobacter (organism)
Rhodotorula rubra (organism)
Rothia mucilaginosa (organism)
Rothia dentocariosa (organism)
Genus Rothia (organism)
Saccharomyces cerevisiae (organism)
Salmonella Adelaide
Salmonella Agona
Salmonella Albany
Salmonella Altona
Salmonella Apapa
Salmonella enterica subsp. arizonae (organism)
Salmonella Bareilly
Salmonella Blockley
Salmonella Bovismorbificans
Salmonella Braenderup
Salmonella Brandenburg
Salmonella Bredeney
Salmonella Choleraesuis (organism)
Salmonella Choleraesuis var. Kunzendorf
Salmonella Corvallis
Salmonella group O:4 (organism)
Salmonella, serogroup C (organism)
Salmonella, serogroup D (organism)
Salmonella, serogroup E (organism)
Salmonella group O:18 (organism)
Salmonella group O:35 (organism)
Salmonella Derby
Salmonella Dublin
Salmonella Duisburg
Salmonella enterica subspecies diarizonae
Salmonella Enteritidis (organism)
Salmonella Gallinarum
Salmonella Give
Salmonella Goldcoast
Salmonella Hadar
Salmonella Havana
Salmonella Heidelberg
Salmonella Indiana
Salmonella Infantis
Salmonella Paratyphi B var. Java
Salmonella Kentucky
Salmonella Kiambu
Salmonella Kumasi
Salmonella Livingstone
Salmonella London
Salmonella Manchester
Salmonella Manhattan
Salmonella Mikawasima
Salmonella Monschaui
Salmonella Montevideo
Salmonella Muenchen
Salmonella Muenster
Salmonella Newport
Salmonella Ohio
Salmonella Oranienburg
Salmonella Panama
Salmonella Paratyphi A
Salmonella Paratyphi B
Salmonella Paratyphi C
Salmonella Pomona
Salmonella Poona
Salmonella Potsdam
Salmonella Reading
Salmonella Richmond
Salmonella Saintpaul
Salmonella Sandiego
Salmonella Schwarzengrund
Salmonella Senftenberg
Salmonella Sinstorf
Salmonella species
Salmonella Stanley
Salmonella Stanleyville
Salmonella enterica subsp. enterica (organism)
Salmonella Tennessee
Salmonella Thompson
Salmonella Typhi (organism)
Salmonella Typhimurium (organism)
Salmonella Typhimurium var. Copenhagen
Salmonella Uganda
Salmonella Virchow
Salmonella Wien
Mold (organism)
Serratia entomophila (organism)
Serratia ficaria (organism)
Serratia fonticola (organism)
Serratia grimesii (organism)
Serratia liquefaciens (organism)
Serratia liquefaciens complex (organism)
Serratia marcescens (organism)
Serratia odorifera (organism)
Serratia plymuthica (organism)
Serratia proteamaculans (organism)
Serratia quinivorans (organism)
Serratia rubidaea (organism)
Genus Serratia (organism)
Serratia ureilytica (organism)
Shewanella algae (organism)
Shewanella putrefaciens (organism)
Shigella boydii (organism)
Shigella dysenteriae (organism)
Shigella flexneri (organism)
Shigella sonnei (organism)
Genus Shigella (organism)
Sphingobacterium multivorum (organism)
Staphylococcus argenteus (organism)
Staphylococcus capitis (organism)
Staphylococcus caprae (organism)
Staphylococcus epidermidis (organism)
Staphylococcus haemolyticus (organism)
Staphylococcus hominis (organism)
Staphylococcus hominis subspecies hominis (organism)
Staphylococcus intermedius (organism)
Staphylococcus lugdunensis (organism)
Staphylococcus pasteuri (organism)
Staphylococcus pettenkoferi (organism)
Staphylococcus saccharolyticus (organism)
Staphylococcus saprophyticus
Staphylococcus simulans (organism)
Genus Staphylococcus (organism)
Staphylococcus warneri (organism)
Staphylococcus xylosus (organism)
Stenotrophomonas acidaminiphila (organism)
Stenotrophomonas maltophilia (organism)
Stenotrophomonas nitritireducens (organism)
Stenotrophomonas rhizophila (organism)
Genus Stenotrophomonas (organism)
Streptococcus agalactiae (organism)
Streptococcus agalactiae serotype Ib (organism)
Streptococcus anginosus (organism)
Streptococcus anginosus group (organism)
Streptococcus canis (organism)
Streptococcus constellatus (organism)
Streptococcus constellatus subspecies constellatus (organism)
Streptococcus constellatus subspecies pharyngis (organism)
Streptococcus cristatus (organism)
Streptococcus dysgalactiae (organism)
Streptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis (organism)
Streptococcus dysgalactiae subspecies dysgalactiae (organism)
Streptococcus equinus (organism)
Streptococcus gallolyticus (organism)
Streptococcus gallolyticus subspecies gallolyticus (organism)
Streptococcus gordonii (organism)
Streptococcus intermedius (organism)
Streptococcus mitis (organism)
Streptococcus mitis group (organism)
Streptococcus oralis (organism)
Streptococcus parasanguinis (organism)
Streptococcus pneumoniae (organism)
Streptococcus pyogenes (organism)
Streptococcus salivarius (organism)
Streptococcus salivarius group (organism)
Streptococcus sanguinis (organism)
Beta-hemolytic Streptococcus, group A (organism)
Genus Streptococcus (organism)
Streptococcus salivarius subspecies thermophilus (organism)
Streptococcus thoraltensis (organism)
Streptococcus vestibularis (organism)
Trichophyton mentagrophytes var. interdigitale (organism)
Genus Ureaplasma (organism)
Ureaplasma urealyticum (organism)
Vagococcus fluvialis (organism)
Veillonella parvula (organism)
Genus Veillonella (organism)
Streptococcus, viridans group (organism)
Weeksella virosa (organism)
Yersinia enterocolitica (organism)
Yersinia enterocolitica serogroup O:3 (organism)
Yersinia enterocolitica serogroup O:5 (organism)
Yersinia enterocolitica serogroup O:9 (organism)
Yersinia pseudotuberculosis (organism)
Zygosaccharomyces bailii (organism)
Toxigenic Clostridium difficile (organism)
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