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Module to parse HELM Notation in the format 1 and 2.

Files of the artifact helm2-helmnotationparser version 1.2.0 from the group org.pistoiaalliance.helm.

Artifact helm2-helmnotationparser
Group org.pistoiaalliance.helm
Version 1.2.0
Last update 24. March 2017
Tags: module helm format parse notation
Organization not specified
URL https://github.com/PistoiaHELM/HELMNotationParser
License MIT License
Dependencies amount 6
Dependencies slf4j-api, slf4j-log4j12, commons-cli, jackson-core, jackson-databind, jdom2,
There are maybe transitive dependencies!

There is a newer version: 1.2.2

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Source code of helm2-helmnotationparser version 1.2.0

META-INF

META-INF.META-INF.MANIFEST.MF

META-INF.maven.org.pistoiaalliance.helm.helm2-helmnotationparser

META-INF.maven.org.pistoiaalliance.helm.helm2-helmnotationparser.META-INF.maven.org.pistoiaalliance.helm.helm2-helmnotationparser.pom.properties

META-INF.maven.org.pistoiaalliance.helm.helm2-helmnotationparser.META-INF.maven.org.pistoiaalliance.helm.helm2-helmnotationparser.pom.xml

.log4j.properties

org.helm.notation2.parser

org.helm.notation2.parser.org.helm.notation2.parser.ConverterHELM1ToHELM2

org.helm.notation2.parser.org.helm.notation2.parser.FinalState

org.helm.notation2.parser.org.helm.notation2.parser.GenerateObjectFromJSON

org.helm.notation2.parser.org.helm.notation2.parser.HELMNotationParserUI

org.helm.notation2.parser.org.helm.notation2.parser.InlineAnnotationsParser

org.helm.notation2.parser.org.helm.notation2.parser.ParserHELM2

org.helm.notation2.parser.org.helm.notation2.parser.StartHELM2Parser

org.helm.notation2.parser.org.helm.notation2.parser.State

org.helm.notation2.parser.org.helm.notation2.parser.StateMachineParser

org.helm.notation2.parser.annotationsection

org.helm.notation2.parser.annotationsection.org.helm.notation2.parser.annotationsection.AnnotationsParser

org.helm.notation2.parser.connectionsection

org.helm.notation2.parser.connectionsection.org.helm.notation2.parser.connectionsection.BetweenInlineConnectionParser

org.helm.notation2.parser.connectionsection.org.helm.notation2.parser.connectionsection.ConnectionsDetailsParser

org.helm.notation2.parser.connectionsection.org.helm.notation2.parser.connectionsection.ConnectionsParser

org.helm.notation2.parser.connectionsection.org.helm.notation2.parser.connectionsection.ConnectionsReadSecondIDParser

org.helm.notation2.parser.exceptionparser

org.helm.notation2.parser.exceptionparser.org.helm.notation2.parser.exceptionparser.AnnotationSectionException

org.helm.notation2.parser.exceptionparser.org.helm.notation2.parser.exceptionparser.ConnectionSectionException

org.helm.notation2.parser.exceptionparser.org.helm.notation2.parser.exceptionparser.ExceptionState

org.helm.notation2.parser.exceptionparser.org.helm.notation2.parser.exceptionparser.FinalStateException

org.helm.notation2.parser.exceptionparser.org.helm.notation2.parser.exceptionparser.GroupingSectionException

org.helm.notation2.parser.exceptionparser.org.helm.notation2.parser.exceptionparser.HELM1ConverterException

org.helm.notation2.parser.exceptionparser.org.helm.notation2.parser.exceptionparser.NotValidHELM2Exception

org.helm.notation2.parser.exceptionparser.org.helm.notation2.parser.exceptionparser.NotationException

org.helm.notation2.parser.exceptionparser.org.helm.notation2.parser.exceptionparser.SimplePolymerSectionException

org.helm.notation2.parser.groupingsection

org.helm.notation2.parser.groupingsection.org.helm.notation2.parser.groupingsection.BetweenGroupingParser

org.helm.notation2.parser.groupingsection.org.helm.notation2.parser.groupingsection.GroupingDetailedInformationParser

org.helm.notation2.parser.groupingsection.org.helm.notation2.parser.groupingsection.GroupingParser

org.helm.notation2.parser.notation

org.helm.notation2.parser.notation.org.helm.notation2.parser.notation.HELM2Notation

org.helm.notation2.parser.notation.org.helm.notation2.parser.notation.ValidationMethod

org.helm.notation2.parser.notation.annotation

org.helm.notation2.parser.notation.annotation.org.helm.notation2.parser.notation.annotation.AnnotationNotation

org.helm.notation2.parser.notation.connection

org.helm.notation2.parser.notation.connection.org.helm.notation2.parser.notation.connection.ConnectionNotation

org.helm.notation2.parser.notation.grouping

org.helm.notation2.parser.notation.grouping.org.helm.notation2.parser.notation.grouping.GroupingAmbiguity

org.helm.notation2.parser.notation.grouping.org.helm.notation2.parser.notation.grouping.GroupingElement

org.helm.notation2.parser.notation.grouping.org.helm.notation2.parser.notation.grouping.GroupingMixture

org.helm.notation2.parser.notation.grouping.org.helm.notation2.parser.notation.grouping.GroupingNotation

org.helm.notation2.parser.notation.grouping.org.helm.notation2.parser.notation.grouping.GroupingOr

org.helm.notation2.parser.notation.polymer

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.BlobEntity

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.ChemEntity

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.GroupEntity

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.HELMEntity

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.MonomerNotation

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.MonomerNotationGroup

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.MonomerNotationGroupElement

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.MonomerNotationGroupMixture

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.MonomerNotationGroupOr

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.MonomerNotationList

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.MonomerNotationUnit

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.MonomerNotationUnitRNA

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.PeptideEntity

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.PolymerElements

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.PolymerEntity

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.PolymerListElements

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.PolymerNotation

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.PolymerSingleElements

org.helm.notation2.parser.notation.polymer.org.helm.notation2.parser.notation.polymer.RNAEntity

org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection

org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.BetweenInlineMonomerParser

org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.BetweenMonomerParser

org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.BetweenParser

org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.RepeatingMonomerParser

org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.SimplePolymersNotationParser

org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.org.helm.notation2.parser.simplepolymerssection.SimplePolymersParser

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